DOI:10.20047/j.issn1673-7210.2025.28.08
中图分类号:R541.4
提拉柯孜·图尔荪, 杨和银, 魏海燕, 吐尔逊娜依·艾海提
| 【作者机构】 | 喀什地区第一人民医院心内科 |
| 【分 类 号】 | R541.4 |
| 【基 金】 | 新疆维吾尔自治区自然科学基金项目(2023D01F14)。 |
急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)以冠状动脉急性缺血缺氧导致心肌坏死为特征,起病急、病情危重、病死率高。我国心血管病患者约3.3亿,其中AMI患者达250万,其发病率呈逐年上升趋势,每年新发病例>100万,死亡率>30%[1-2]。鉴于其严重性和负担日增,早期诊断、早期治疗、预后评估对改善患者结局至关重要。微RNA(microRNA,miRNA)作为高度保守的内源性单链非编码RNA,已成为血管疾病中极具潜力的生物标志物和治疗靶点[3-4]。在动脉粥样硬化、急性冠脉综合征、心力衰竭及心肌纤维化等多种心血管疾病中均观察到miRNA表达谱的显著改变[5-7]。这些miRNA通过调控血管内皮功能、细胞增殖、凋亡与自噬等过程参与心血管疾病的发生和发展[7-8]。因此,系统筛选鉴定AMI关键差异表达miRNA具有重要的临床意义。本研究拟应用转录组学结合生物信息学方法筛选AMI患者外周血关键差异表达miRNA并进行验证,为其早期诊断、早期治疗提供新的生物学标志物及靶点。
选取2025年1月至6月喀什地区第一人民医院心内科收治20例AMI患者作为AMI组,按性别、年龄1∶1匹配20例冠状动脉造影正常者作为对照组。AMI诊断依据《2025年ACC/AHA急性冠脉综合征管理指南》[9],符合缺血性胸痛、特征性心电图动态演变或心肌标志物升高中任意两项。纳入标准:①符合AMI诊断标准;②18岁<年龄<80岁;③签署知情同意书。排除标准:①存在严重心功能不全;②近3个月有不稳定型心绞痛、脑卒中;③合并严重肝、肾功能不全;④罹患急性疾病或处于慢性疾病急性加重期;⑤近期存在创伤、感染、手术等应激状态;⑥妊娠期或哺乳期妇女或拒绝参与者。
本研究经喀什地区第一人民医院医学道德伦理委员会审核批准,伦理批件号为[2024]快审研第(19)号,研究对象均知情同意。
1.2.1 样本收集 于患者入院时(0 h)立即采集两管肘前静脉血(每管4~6 ml)。其中第1管血样静置20 min后,以3 000 r/min离心10 min分离血清,用于检测肌钙蛋白等心肌损伤标志物;第2管全血样本采集后立即置于液氮中速冻,随后转移至-80℃超低温冰箱保存,用于后续转录组学测序分析。整个采集处理过程严格执行标准化操作规范,以保证样本质量满足后续实验分析要求。
1.2.2 文库构建和测序 采用RNA提取试剂盒(生产商:北京转基生物科技有限公司,货号:ER501-01)提取血液样本总RNA后,进行小RNA(18~40 nt)富集,连接3’和5’端测序接头,经反转录和RT-qPCR扩增构建双链cDNA文库。纯化筛选18~40 bp片段后,质检合格的文库按比例混合,使用Illumina HiSeqTM 4000平台进行双端测序,获取mRNA原始数据。
1.2.3 miRNA表达及差异分析 采用TPM对miRNA表达量进行归一化处理,TPM=(miRNA计数片段×1 000 000)/所有miRNA计数片段的总和[10]。对于生物学重复的样品,采用DESeq2进行两个组之间的差异表达分析[11]。对于无生物学重复的样品,采用edgeR TMM算法标准化处理后进行差异表达分析[12]。
1.2.4 富集分析 采用clusterProfiler软件包对差异表达基因进行系统功能注释。基于基因本体(gene ontology,GO)数据库进行功能富集分析,筛选校正P<0.05的显著富集条目;同时采用京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)进行通路富集分析,通过超几何检验鉴定显著富集通路(校正P<0.05)。
1.2.5 RT-qPCR检测方法 采用RNA提取试剂盒(生产商:北京转基生物科技有限公司,货号:ER501-01)提取血液总RNA,经质检合格后使用反转录试剂盒(生产商:北京转基生物科技有限公司,货号:AU341)合成cDNA;随后RT-qPCR扩增在StepOne PlusTM 系统上进行:20 μl反应体系含SYBR Green Master Mix 10 μl、10 μmol/L正反向引物各0.8 μl及cDNA模板2 μl,ddH2O 6.4 μl;程序:95 ℃预变性30 s,40个循环(95 ℃变性10 s,60 ℃退火/延伸30s);最终通过2-ΔΔCt法对目标miRNA进行相对定量分析。各基因的引物序列见表1。实验独立重复至少3次。
表1 基因引物序列
1.2.5 评估血管内皮功能 验证冻存后人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cells,HUVEC)的核心功能——小管生成能力。实验分成对照组(未转染细胞),miRNA阴性对照组(转染无关序列的模拟物)及let-7e-5p组(HUVEC转染let-7e-5p模拟物)。具体操作步骤如下:①铺胶。冰上加20 μl Matrigel/孔,37 ℃凝固1 h;②接种。消化HUVEC,调至高密度(约2.5×105/ml),每孔加1 ml细胞悬液;③转染。约70%密度时,按体系转染let-7e-5p mimic;④培养和观察。转染后37 ℃培养24 h,显微镜拍照;⑤分析。Image J定量小管数,与对照组比较计算相对血管生成能力。实验独立重复至少3次。
采用GraphPad Prism 9.0统计学软件进行数据分析。计量资料采用均数±标准差(
±s)表示,组间比较采用t检验,若组间数据方差齐性,两组比较采用独立样本t检验;若方差不齐,则选用非参数Mann-Whitney U检验。以P<0.05为差异有统计学意义。
转录组学分析鉴定出44个差异表达miRNA,包括26个上调miRNA和18个下调miRNA。通过火山图(图1)展示了这些差异表达miRNA的分布特征,其中上调miRNA以红色标记,下调miRNA以绿色标记。聚类热图(图2)进一步展示表达特征,具体miRNA列表见表2。
图1 差异miRNA火山图
图2 差异miRNA聚类图
AMI:急性心肌梗死。
表2 差异表达miRNA
GO功能分析结果显示,AMI组差异miRNA显著参与蛋白质磷酸化、磷酸化、细胞内信号转导、小GTP酶介导的信号转导及离子转运等生物学过程(图3),差异有统计学意义(校正P<0.05)。KEGG分析揭示其主要参与细胞黏附分子、钙信号通路、CAMP信号通路、Rap1信号通路及心肌细胞肾上腺素能信号传导(图4),差异有统计学意义(校正P<0.05)。
图3 GO富集分析
GO:基因本体。
图4 KEGG富集分析
KEGG:京都基因和基因组数据库。
RT-qPCR验证结果显示,与对照组比较,AMI组let-7e-5p和miR-1-3p表达上调(P<0.05),而let-7b-5p、let-7c-5p和miR-10527-5p下调(P<0.05),与转录组学结果一致。见图5。
图5 RT-qPCR检测差异表达miRNA表达水平
AMI:急性心肌梗死。
与对照组及miRNA阴性对照组比较,let-7e-5p组血管内皮小管形成能力显著下降,提示血管内皮功能受损(图6)。
图6 let-7e-5p对血管内皮功能的影响(100×)
AMI是心血管急危重症,具有较高的发病率与死亡率,构成重大公共卫生问题。尽管AMI诊断和治疗策略有了很大的改进,但其仍然是最致命的心脏病类型之一。研究表明,循环中miRNAs通过影响血管内皮功能、细胞凋亡等过程参与AMI发生和发展[7,13]。因此,AMI中系统筛查miRNAs可能为其早期诊断和治疗提供潜在生物标志物和新的靶点。
本研究通过转录组学测序发现AMI中存在44个差异表达miRNA(26个上调,18个下调)。其靶基因在蛋白质磷酸化、胞内信号转导、小GTP酶介导的信号转导及离子传输等过程中显著富集。KEGG分析显示,差异基因主要参与细胞黏附分子、钙信号、环腺苷酸信号、Rap1信号和心肌肾上腺素能信号通路。筛选表达量前5位的miRNA,经RT-qPCR验证与转录组学测序结果一致:AMI组let-7e-5p和miR-1-3p表达升高(P<0.05),而let-7b-5p、let-7c-5p和miR-10527-5p表达降低(P<0.05)。既往研究表明,let-7e-5p在心力衰竭、非ST段抬高型心肌梗死等患者中表达升高,与本研究结果一致[14-15]。同时,miR-1-3p的上调结果与Badacz等[16]关于急性冠脉综合征患者中miR-1-3p显著增高,并可作为心血管事件独立预测因子的发现相符。然而,本研究发现let-7b-5p与let-7c-5p的下调与既往冠心病研究存在差异,推测可能与本研究纳入的维吾尔族人群(占90%)遗传特性相关[17-19]。此外,本研究发现miR-10527-5p在AMI中下调,其机制有待深入探索。
本研究还发现,let-7e-5p高表达组血管内皮小管形成能力显著下降,血管内皮功能受损。作为let-7家族关键成员,let-7e-5p通过靶向抑制NF-κB通路的关键负调控因子I κBβ,促进NF-κB的核转位和活化,增强血管内皮的炎症反应[20]。最新研究也发现,let-7e-5p通过靶向TAB2抑制NF-κB信号通路保护口腔黏膜免受损伤[21]。Mompeón等[13]报道let-7e-5p抑制剂转染HUVEC会使HUVEC的管状结构数量增加20%,与本研究结果相符。总之,let-7e-5p通过各种途径导致血管内皮功能紊乱,靶向抑制let-7e-5p有望成为改善病理性血管生成障碍的新策略。
综上所述,本研究通过转录组学结合生物信息学分析鉴定出let-7e-5p、miR-1-3p、let-7b-5p、let-7c-5p和miR-10527-5p等5个关键差异表达miRNA,其可能通过调控血管内皮功能等途径参与AMI的发生和发展。研究结果为AMI发病机制、诊断标志物及治疗靶点的探索提供了实验依据,后续将深入解析其作用机制及调控网络。
利益冲突声明:本文所有作者均声明不存在利益冲突。
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